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大豆是我国重要的粮食作物，其含丰富的植物蛋白，营养价值丰富，利于人们的身体健康。但把分子辅助育种直接用于育种实践还存在实际难度，尽管已定位的大豆蛋白质含量相关QTL数目比较多，但由于数量性状很容易受到外界环境的影响，很难发掘出多环境下的稳定位点。在大多数研究中，图谱标记较少，密度不够，定位出的QTL标记区间比较大，不能获得真实有效的位点。大豆蛋白质含量是由多基因控制的数量性状，大部分基因都是微效作用，并且各微效位点之间存在着上位性关系，我们知道微效基因之间相互作用能够显著提高蛋白含量，但目前这方面的研究还很少。