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文章认为，从超循环理论始，系统科学进一步从有机整体论走向生成整体论.超循环理论直探自然界从无生命到生命的进化机制——即进化信息乃至生命信息发生与完成的机制，生成规律本质上是信息规律，它决定了复杂性生成系统的一系列重要特征．由于生成过程基于两种相反相成力量或趋势相互作用，以及生成性系统的质的相似性，决定了研究系统生成的逻辑除了形式逻辑，尚有待辨证与类比逻辑以及相关数学的发展.复杂性生成系统的研究需要新的科学研究纲领．首先应突破西方传统原子论的方法论，本文提出以“复元论”或“归源论”超越“还原论”，并认为超循环理论第一次将价值引入了科学，为我们建构内涵价值的生成论科学提供了重要启示．