小麦钙网蛋白基因TaCRT-A多态性分析及其定位

来源 :第三届全国小麦基因组学及分子育种大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yilvQINGFENG
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  以苗期抗旱性不同的37份六倍体普通小麦(AABBDD)、3份A基因组材料(AA)和3份四倍体小麦(AABB)为材料,通过直接测序法检测TaCRT-A基因的单核苷酸多态性,分析该基因多态性与小麦苗期抗旱性的关系,并进行遗传定位.TaCRT-A 基因DNA长度为3887 bp,在总长度为167141 bp的核苷酸序列中共检测到202个核苷酸变异位点,其中包括165个SNP和37个InDel,二者出现的频率分别为1/1013 bp 和1/4517 bp.编码区的核苷酸多样性π值小于非编码区,说明编码区所承受的选择压力较大.单倍型分析表明,43份供试材料可分为14种单倍型,其中H1、H2和H13分别只含有普通小麦二倍体野生近缘种A基因组供体种的1份材料,H6、H7分别包含抗旱性极强的1份材料,H8包含四倍体波斯小麦、并同时包含抗旱材料与干旱敏感材料,H11主要包括强抗旱材料与中等抗旱材料;虽然TaCRT受水分胁迫诱导表达,但TaCRT-A基因的结构多态性分析未能揭示其多态性与小麦苗期抗旱性之间的直接关系;利用RIL群体(Opata 85×W7984)将该基因定位于3A染色体标记Xmwg30~Xmwg570之间,遗传距离分别为10.5 cM和49.6 cM.
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