【摘 要】
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CCCH类锌指蛋白包括三个半胱氨酸和一个组氨酸组成的结构域,在RNA代谢的各个层次起重要作用。植物锌指蛋白是一个大的基因家族,在模式植物拟南芥中有68各成员,水稻中67个
【机 构】
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中科院生物燃料重点实验室,山东省能源生物遗传资源重点实验室,中国科学院青岛生物能源与过程研究所,266101
【出 处】
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第五届中国工业生物技术发展高峰论坛
论文部分内容阅读
CCCH类锌指蛋白包括三个半胱氨酸和一个组氨酸组成的结构域,在RNA代谢的各个层次起重要作用。植物锌指蛋白是一个大的基因家族,在模式植物拟南芥中有68各成员,水稻中67个成员,研究表明它们在器官发育,环境胁迫中均起关键作用。然而,在模式林木杨树中还未曾见相关报道。本文利用生物信息学详细分析了杨树CCCH基因家族的进化,结果表明,杨树中共有91个成员,按照同源关系分为18个亚家族；每个亚家族成员的基因结构和保守域都相对保守；其中,90个成员不均衡地分布在19对染色体上,大部分由复制进化而来；鉴定的31个基因对中,20对属于复制进化,3对属于随机复制；随后,我们进一步对这些基因的表达模式进行了分析,结果表明,杨树CCCH锌指蛋白呈现多样化的表达模式,其中34个基因在根中大量表达,22基因富集在次生木质部(图1)。我们从中挑取了12个基因,利用RT-qPCR分别对它们的组织特异性和抗旱性进行了验证。这些结果为进一步从分子水平上阐明CCCH类锌指蛋白的功能奠定了基础。
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