【摘 要】
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通过生物信息学的方法,从塔玛亚历山大藻的ESTs数据库中筛选微卫星(simple sequence repeat,SSR)位点,设计SSR引物,利用毛细管电泳对4株塔玛亚历山大藻(Alexandrium tamarens
【机 构】
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暨南大学生物工程学系,广东广州 510632
【出 处】
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中国海洋学会赤潮研究与防治专业委员会第二届学术研讨会
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通过生物信息学的方法,从塔玛亚历山大藻的ESTs数据库中筛选微卫星(simple sequence repeat,SSR)位点,设计SSR引物,利用毛细管电泳对4株塔玛亚历山大藻(Alexandrium tamarense)、2株相关亚历山大藻(Alexandrium arrive)和1株链状亚历山大藻(Alexandrium catenella)进行了种内、种间遗传多样性分析,获得以下主要结果；(1)从6830条非冗余的ESTs中共查找到222个SSR,三核苷酸重复在所有的重复类型中所占比例最大,重复单元CTG/CAG出现频率最高；(2)种内遗传多样性水平整体偏低,种间遗传多样性水平较高,种间遗传分化系数较高；(3)对7个样品的聚类图分析发现,A.tamarense CCMP116与A.affine CCMP112遗传距离极为接近；A.tamarenseATHK9301,CCMP1598和ATDH01相互聚在一起；A·catenella ACDH01与A.tamarens,分属两枝.以上结果表明,SSR标记在亚历山大藻遗传多样性分析方面可能是一种非常有用的工具.
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