【摘 要】
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长期以来,甲型H3N2流感病毒一直是威胁人类健康的重要病原体之一,对其变异规律进行深入的分析研究在流感的防治工作中具有重要的意义[1],其中对血凝素(HA)基因变异的研究工作最为重要.目的对1990-2013年全球甲型H3N2流感病毒血凝素的基因和进化特征进行研究.方法从NCBI的流感病毒数据库下载1990--2013年人源甲型H3N2流感病毒HA基因样本,采用数值映射和PCA聚类的方法进行序列分
【机 构】
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石家庄铁道大学信息科学与技术学院,河北石家庄市050043
【出 处】
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SCEG2014研讨会(2014年“计算机科学与技术及教育技术“学术研讨会)
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长期以来,甲型H3N2流感病毒一直是威胁人类健康的重要病原体之一,对其变异规律进行深入的分析研究在流感的防治工作中具有重要的意义[1],其中对血凝素(HA)基因变异的研究工作最为重要.目的对1990-2013年全球甲型H3N2流感病毒血凝素的基因和进化特征进行研究.方法从NCBI的流感病毒数据库下载1990--2013年人源甲型H3N2流感病毒HA基因样本,采用数值映射和PCA聚类的方法进行序列分析和进化研究,并用MATLAB绘制聚类图直观表示结果.结果PCA分析中前两个主成分占93.88％.聚类图中1990-1999年,2000-2005年,2006-2013年数据聚类成三部分,但是这三部分并没有特别明显的间隔.三维图中数据呈现为比较连续的曲线.结论1990-2013年期间甲型H3N2流感一直渐进的进化,但并未出现大的基因重组,并没有使血凝素基因特性发生明显改变.
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