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计算酶再设计是一种可用于快速改造酶底物特异性和催化活性的方法，具有重要的理论意义和工业价值。在过去十多年中，计算酶再设计方法取得了重大进展并成功改造了多种天然酶，但是限于蛋白-配体相互作用中能量模型的精确程度以及序列优化算法的计算能力，许多通过计算设计得到的酶突变体对目的底物仅具有较低的催化活性。