SWI/SNF染色质重组复合物失调研究

• 作 者: 姚毅冰[1]AdiGazdar[2]吴志浩[1]尤嘉琮[1]李洋[1]刘彬[1]祖玲玲[1]周清华;
• 机 构: 天津市肺癌转移与肿瘤微环境重点实验室
• 出 处: 第13届全国肺癌学术大会
• 发表日期: 2013年期

目的:探讨肺癌中SWI/SNF染色质重组复合物异常调节的现象和机制,两个ATP酶催化蛋白BRG1(SMARCA4)和BRM(SMARCA2),以及辅助蛋白BAF250a(ARID1A)在SWI/SNF染色质重组中的作用及分子机制。方法:来自吸烟者与非吸烟者的101例肺癌细胞株和83例非小细胞肺癌及配对良性肺组织样本用于此项研究;应用NextGen测序和Sanger测序技术用于对肺癌细胞株DNA的SWI/SNF染色质重组复合物基因进行测序;应用Western Blot技术检测肺癌细胞株核蛋白提取物中部分SWI/SNF染色质重组复合物的蛋白表达水平;应用化学诱导甲基化用于检测BRM蛋白缺失的细胞株;应用基因芯片用于检测肺癌细胞株和组织样本中全基因组基因的表达水平;应用单核苷酸多态性芯片分析用于检测肺癌细胞株和组织样本中全基因组基因的拷贝数变化;应用免疫组化芯片染色用于对肺癌组织中BRG1和BAF250a的表达进行分析。结果:1.NextGen测序和Sanger测序证实SMARCA4和SMARCA2的突变率分别为28％(主要是纯合子缺失突变)和0％,ARID1A的突变率为11％(主要是杂合子点突变).2.WesternBlot检测证实BRG1和BRM蛋白表达缺失率分别为32.5％和25％,BAF250a的蛋白表达缺失率为23％,且这3个蛋白中至少有1个在41％的肺癌细胞株缺失,两个或两个以上蛋白缺失的细胞株比例为16％。3.基因芯片和免疫组化芯片的综合分析表明这3个基因在肺癌细胞株和组织中的表达水平普遍降低。4.单核苷酸多态性芯片分析DNA的拷贝数,表明组成SWI/SNF染色质重组复合物的多个基因有等位基因缺失。5.甲基化研究证实有些SWI/SNF染色质重组复合物异常调节与表观遗传有关。结论:(1)肺癌中存在SWI/SNF染色质重组复合物异常调节的现象,而且这种现象与多种机制有关,包括缺失,突变,表观遗传,转录和翻译控制等。(2)SWI/SNF染色质重组复合物异常调节可能为肺癌治疗提供新的靶点。