【摘 要】
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本研究应用新一代高通量测序技术Roche 454对大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种进行转录组测序并建立ESTS数据库，结果得到北方亚种和佛罗里达亚种EST序列分别是468671和3323
【机 构】
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中国水产科学研究院珠江水产研究所,中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,广东 广州 510380
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本研究应用新一代高通量测序技术Roche 454对大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种进行转录组测序并建立ESTS数据库，结果得到北方亚种和佛罗里达亚种EST序列分别是468671和332322条，平均长度分别是306.5bp和304.4bp.并将得到的高质量序列进行拼接，大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种共得到Contig序列总数分别为42056条和35743条，平均长度分别是612.6bp和588.2bp.将大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种的数据库合并，通过与蛋白数据库KEGG的比对后，共78938条EST序列被注释，由注释所含Gene Ontology (GO)信息，对序列按照分子功能、细胞功能、生物学过程进行分类.通过对大口黑鲈合并的EST库信息进行大通量SSR和SNP位点的发掘，发现了含SSRs和SNP序列分别是25469和8547条.
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