依存信息在蛋白质关系抽取中的作用

• 作 者: 刘兵 徐华 钱龙华 周国栋
• 机 构: 苏州大学计算机科学与技术学院,江苏,苏州,215006 江苏省计算机信息处理技术重点实验室,江苏,苏州,215006
• 出 处: 第五届全国青年计算语言学研讨会(YWCL 2010)
• 发表日期: 2010年期
• 关键词: 句法信息 蛋白质 关系抽取 特征向量 PPI 性能 计算复杂度 语料库 实验 基本短语 结构化 核函数 系统 词汇 测度 捕获

基于核函数的蛋白质关系(PPI)抽取可以捕获结构化句法信息，取得了较高的性能，但计算复杂度过高。
本文结合词汇、句法信息，重点探讨了依存信息对基于特征向量的蛋白质关系(PPI)抽取的影响。研究表明，依存信息和基本短语块信息可以有效提高基于特征向量的PPI抽取性能。本文在多个PPI语料库上进行了实验，其中在AIMed语料上的实验取得了F测度为54.7的较好性能，是目前基于特征向量的PPI抽取系统的最好水平。