柞蚕全长cDNA文库中筛选到一个与蛹滞育解除相关的KK-42结合蛋白基因

来源 :中国蚕学会第六届青年学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lovetianbing
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我们成功构建了柞蚕Antheraea pernyi蛹的全长cDNA文库。总RNA提取自处于滞育后期的单个新鲜雌蛹。所构建文库的滴度是5×105cfu/ml,重组率达到95%。表达序列标签(EST)测序得到了250个有效序列,它们可以聚成175个单基因簇,其中包括24个重叠群和151的单拷贝。生物信息学分析结果表明,这175个单基因簇中有97个(55.4%)在数据库中有同源序列(其中只有5个是柞蚕已知基因),37个(21.2%)在数据库中有EST同源序列但缺乏功能注释,41个(23.4%)为新的EST。通过EST测序,我们从该文库中鉴定了柞蚕KK-42结合蛋白基因(ApKK42-BP;GenBank登录号FJ744151),该基因与天蚕Antheraea yamamai的KK-42结合蛋白基因在氨基酸序列上的一致性高达95%,而KK-42结合蛋白基因与天蚕的幼虫滞育解除有关。蛋白质序列分析表明,ApKK42-BP是一个胞外蛋白而不是膜蛋白,其信号肽位于第1-18。ApKK42-BP包括2个推测的保守功能域abhydro_lipase和abhydrolase_1,这一结果表明该蛋白可能是一种脂肪酶。基于EST数量的表达发现,ApKK42-BP在滞育的后期是一个高表达基因,表明该基因与柞蚕的蛹滞育解除也有关系。
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