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本研究对分离自近海沼泽地大米草根际的一株海洋细菌MWYL1进行了形态观察、生理生化检测和16S rRNA基因扩增与序列分析,初步鉴定其分类地位为海洋单胞菌属(Marinomonas)。该菌为革兰氏染色阴性,直杆状。16S rRNA基因序列的Blast分析表明:该菌与Marinomonas pontica和Marinomonas dokdonensis的序列相似性分别为97%和95%。
本研究还构建了该菌的基因组fosmid文库,文库大小2.0X 106克隆,外源插入片段平均为35—40 kb。在LB平板上直接筛选到能够产生非水溶性黑色素的阳性克隆,经亚克隆得到约14kb的外源DNA插入片段,完成了全序列测定,并对功能片段作了生物信息学的初步分析。
海洋是地球早期生命的诞生地,具有高压、高盐、低营养、低温、无光照和局部高温等独特的生态环境。海洋微生物为了适应这一环境,演化出了类群的特异性和代谢途径的多样性,其初级和次生代谢产物种类繁多、结构新颖,可以产生与陆地微生物完全不同的生物活性物质。目前海洋生物资源的研究和开发已为世界各国的重视,成为自然科学中十分活跃的研究领域之一。黑色素(melanin)是一类由细菌、真菌和动植物产生的多酚聚合物,具有复杂的结构。它作为一种次生代谢产物,虽不为生长所必需,但与防御功能有关,能防御很多胁迫因子(诸如紫外线、氧化剂、自由基等),最近还有报道称黑色素具有抗菌活性。本文对从近海分离到的一株海洋细菌MWYL1进行了初步鉴定,分离到与黑色素生物合成相关的功能基因簇,并且对该基因簇进行了生物信息学的初步分析。