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由多主棒孢引起的棒孢霉落叶病是橡胶树的重要叶部病害之一。在全球植胶区，该病害已经成为影响天然橡胶产量的重要限制因子，国内病情蔓延迅速。据报道，毒素是多主棒孢病菌的重要致病因子，且存在多个亚型。利用已公布的多主棒孢不同毒素蛋白亚型基因的特异引物对我国橡胶树多主棒孢的毒素类型进行了分子检测，研究发现：我国的橡胶树多主棒孢存在Cas2和Cas5两种毒素蛋白亚型，其中Cas5型为优势群体，并且为橡胶树上多主棒孢特有毒素亚型，而Cas2为橡胶树和其他作物多主棒孢共有毒素亚型。还有部分菌株未检测到cassiicolin毒素基因。在所有供试菌株中未发现Cas1(主要存在于非洲和菲律宾橡胶树树多主棒孢)、Cas6(其他作物)、Cas3和Cas4(存在于橡胶树内生多主棒孢菌株)亚型毒素蛋白基因。研究中分离获得了一个与已报道毒素蛋白分子量存在差异的新毒素蛋白。这不仅有助于阐明橡胶树多主棒孢毒素类型及其致病机理，也可为作物多主棒孢病害的抗病育种和防治新策略的制定提供理论依据。