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目的：了解流行毒株核蛋白和糖蛋白的基因特征，并对流行毒株与疫苗毒株的核蛋白和糖蛋白的基因序列进行比较分析。方法：分别采用直接免疫荧光(dFA)和巢式RT PCR方法检测狂犬病病例和宿主动物标本的病毒抗原和核酸，对病毒核酸阳性标本进行核蛋白和糖蛋白基因序列测定和拼接，并结合已发表疫苗毒株基因序列对流行毒株与疫苗毒株基因序列进行比较分析。结果：贵州省狂犬病病毒流行毒株均属基因1型，但在核蛋白和和糖蛋白基因核苷酸及推导的氨基酸水平上均发生了不同程度的变异，且这些变异具有地域和时间分布特性。与常用的人用疫苗毒株比较，流行毒株与人用的CTN毒株的核蛋白和糖蛋白基因核苷酸和氨基酸序列同源性最高。结论：贵州省狂犬病病毒流行毒株仍为基因1型，但在核蛋白和糖蛋白基因核苷酸及推导的氨基酸水平上发生了不同程度的变异，此外，贵州省近年的流行毒株与人用疫苗株CTN和动物用疫苗毒株Flury的差异最小。