【摘 要】
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在大肠杆菌中,RNA分子伴侣蛋白Hfq是一个重要的转录后调节因子.Hfq是由一个进化上保守的Sm结构域和一个柔性的羧基端尾巴所组成,其中Sm结构域形成一个同源六聚体的核心,
【机 构】
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合肥微尺度物质科学国家实验室,中国科学技术大学生命科学学院,安徽合肥230026
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在大肠杆菌中,RNA分子伴侣蛋白Hfq是一个重要的转录后调节因子.Hfq是由一个进化上保守的Sm结构域和一个柔性的羧基端尾巴所组成,其中Sm结构域形成一个同源六聚体的核心,而羧基端的尾巴却没有固定的结构并且在不同种类的细菌中变化很大.早前关于Hfq结构和功能的研究中发现截断了羧基端尾巴仅保留核心区域的Hfq65无法促成DsrA介导下的RpoS合成[1].后来Beich-Frandsen等通过检测截取不同长度羧基端尾巴的Hfq的活性发现羧基端的氨基酸残基75-85在与RNA的结合中十分重要,并通过同步辐射圆二色谱和小角散射的分析表明羧基端尾巴的柔性很大且伸展在核心四周[2].在这里,通过顺磁弛豫增强和分子动力学模拟,我们发现Hfq的羧基端尾巴并不是完全地伸展在核心区域的外面,而是能够更加靠近Hfq 核心区域的近端面.
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