【摘 要】
：
APOBEC3G能使新逆转录出来的病毒DNA负链上大部分C发生脱氨基化变成U,使正链DNA发生dG→dA超突变,引进终止密码子,或激活无嘌呤,无嘧啶内切酶,使病毒DNA不能复制.APOBEC3
【机 构】
：
中国科学院上海有机化学研究所,生命有机化学国家重点实验室,零陵路345号,上海200032中国科学院上海生物化学与细胞研究所,上海200031
论文部分内容阅读
APOBEC3G能使新逆转录出来的病毒DNA负链上大部分C发生脱氨基化变成U,使正链DNA发生dG→dA超突变,引进终止密码子,或激活无嘌呤,无嘧啶内切酶,使病毒DNA不能复制.APOBEC3G 蛋白包括CD1 和CD2 两个结构域,其中CD1 主要与HIV 病毒gag 蛋白作用使APOBEC3G 蛋白进入病毒颗粒,并与HIV-1 病毒的Vif 蛋白相互作用,使APOBEC3G 发生泛素化降解；CD2 主要负责催化DNA 胞嘧啶脱氨基化.尽管目前CD2 单体晶体结构、NMR溶液结构和tail to tail 二聚体晶体结构均有报道,但有关APOBEC3G 与ssDNA作用机制仍不清楚.为此,在ssDNA 的存在下,我们对APOBEC3G-CD2 进行了晶体学研究,获得了分辨率1.8(A) 的、结构新颖的head to tail 二聚体晶体结构.在APOBEC3G-CD2 的head to tail 二聚体结构中,存在一个独特的作用界面.定点突变、动态光散射、NMR 技术辅助测定Km 和Kcat 等研究表明,二聚体作用界面对APOBEC3G-CD2 聚集状态以及脱氨基化的活性有着重要影响.在其表面图上,存在一个连续的槽,沿着这个槽,可以依次发现：APOBEC3G-CD2上与ssDNA结合及酶活相关的关键性因子loop1、loop3、loop5、loop7 和α6（包括残基P210、Q245、H250、D264 和Q380）以及已经被证实的残基R215、R256、H257、W285、R313、Y315、D316、D317、R320,APOBEC3G-CD1 上已经报道的与ssDNA 结合及酶活相关的关键残基对应位置.通过分析APOBEC3G 的脱氨基化的极性,方向性以及存在的死区域,还有SAXS 的结构模型,我们推测head to tail 的二聚体晶体结构模拟了APOBEC3G 蛋白全长结构.
其他文献
肿瘤是人类死亡的主要原因之一,近三十年来,国内外对肿瘤研究都给予了极大关注,研究肿瘤的发病机理,寻找肿瘤标志物,期望实现肿瘤的早期诊断和有效治疗.我国恶性肿瘤的发病和
反向蛋白微阵列(Reverse Phase Protein Array,RPPA)是将细胞裂解液按规则的阵列形式固定在载玻片表面上形成的一种蛋白微阵列,能够系统地、半定量地研究细胞裂解液中特定蛋
利用原子层沉积(ALD)在硅衬底上制备了不同厚度的的氧化铝(Al2O3)薄膜.原子力显微镜(AFM)的测量结果表明制备的Al2O3 薄膜表面平整,并且均方根粗糙度(RMSroughness)低于1 nm.
BiFeO3 (BFO)具有三方扭曲的钙钛矿结构,在室温下同时具有铁电有序和G型反铁磁有序两种结构,是少数在室温下同时具有铁电性(Tc=1103 K)和铁磁性(TN=643 K)的铁磁电材料之一,
近年来,以铅(Pb)为基底的ABO3 钙钛矿材料成为研究的热点,这是由于其在准同型相界(MPB)附近具有卓越的性质(如:铁电、反铁电、压电与热释电效应).[1] 锆钛酸铅(PZT)体系作为
磁共振成像在医疗影像领域有着重要的作用,它已经广泛应用于大脑,心脏等器官组织的疾病检测中.与CT等医疗成像相比,它对人体没有伤害.由于人体组织结构的异质性,在组织分界面
自2006年开始,基因组的重新测序有效地鉴定了细菌适于新环境时所引起的基因突变[1].然而,相关的促生长机制还没有得到很好的诠释.本文联合利用代谢组学、蛋白质组学和脂类组
常用传统中药附子具有回阳救逆、补火助阳、散寒止痛之功效,但附子的毒性较大,在临床上常与甘草等配伍用药,以达到减毒增效的目的,如四逆汤、附子理中丸等.目前,国内外关于附
丙型肝炎是一种由丙型肝炎病毒(hepatitis Cvirus)所引起的病毒性肝炎,是慢性肝炎的主要病原之一,严重时会导致肝硬化和肝癌[1].目前估计全世界有1亿7千万人感染丙型肝炎病毒
糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)是糖尿病严重的慢性并发症之一,同时也是导致终末期肾脏疾病的重要因素,已经成为世界上主要的健康问题[1].糖尿病肾病的发病机制目前尚