【摘 要】
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为了解江西省猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的遗传变异情况,本研究设计了3对引物,扩增得到11株江西株S1全基因序列,并对其同源性及遗传进化进行了
【机 构】
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江西农业大学动物科技学院,江西南昌330045
【出 处】
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中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第十次学术研讨会
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为了解江西省猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的遗传变异情况,本研究设计了3对引物,扩增得到11株江西株S1全基因序列,并对其同源性及遗传进化进行了分析.结果表明:11株江西分离株与疫苗株CV777核苷酸序列的同源性为92.3％～92.8％,氨基酸序列同源性为90.9％～91.2％;江西株各毒株间S1基因核苷酸同源性为97.6％～99.8％,氨基酸同源性为97％～99.6％;与CV777相比,所有江西株在核苷酸及氨基酸序列上均存在突变,包括插入和缺失现象,并且插入及缺失位点与韩国株KNU-0905相似.通过构建PEDV S1基因遗传进化树发现,PEDV S1基因遗传关系上分为2个大的群组,11个地方流行株全部都集中在G1组的G1-1亚组群中,而疫苗毒株CV777的S1序列属于G2亚群.对S1基因抗原表位域(COE)与抗原表位(S1D5,S1D6)分析表明:11株江西株的COE序列没有氨基酸缺失和插入,但是均存在氨基酸点突变,突变数目为7-9个不等;S1D5表位、S1D6袁位除少数毒株存在突变外其余均保守.序列分析表明,江西地方流行毒株之间S1基因存在不同程度的遗传变异,与疫苗毒株CV777存在较大的变异.推测,这些存在于S1基因间的变异,特别是在抗原表位区域COE与S1D5、S1D6的不同程度的变异,或许会影响现今使用的基于早期欧洲毒株CV777的疫苗对当前的流行毒株所造成的腹泻的作用效果.
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