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目的：通过对南沙港入境货轮的检疫结果分析，探讨对不同货轮的检疫措施，为下一步改革创新监管模式提供科学依据。方法：对南沙货港2010年入境的货轮区分为3个类型：港澳小型货轮、国际航行货轮和入境维修船舶，并分别根据检疫结果进行分析整理。结果：对2010年入境的4241名船员实施卫生检疫，发现可疑病例5例，均在国际航船舶中发现。其中确诊为登革热传染病的有1例。对2010年入境船舶实施查验547艘次，截获各类疫情30批次，其中来源于港澳地区的入境维修船舶疫情截获率达47.8％，显著高于港澳小型货轮，国际航行的船舶疫情截获率也达16.5％，也明显高于来源于港澳地区的小型货轮。结论：国际航行船舶的船员出现携带疫情的现象仍时有发生。入境维修船舶和国际航行船舶的疫情携带率均比较高。为提高疫情检出率，防止疫情传播，必须对这类船舶加大查验力度，同时，应切实制定好各类应急预案，培训相关专业人员，这是妥善应对突发公共卫生事件的关键。