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20世纪80年代以来，转基因作物在为害虫综合治理(IPM)和解决世界粮食不足等问题做出巨大贡献的同时，也给生态系统和人类社会带来了许多潜在的隐患和威胁。大面积种植转基因作物使农田生态系统的物种呈现单一化趋势，改变生物群落的结构和功能，破坏生态系统中的生物多样性。转基因作物影响靶标害虫的存活率、生殖力和种群数量，对靶标害虫通常有较好的控制效果。转基因作物对非靶标生物也有可能产生直接或间接的影响，对非靶标害虫可能没有控制作用或控制效果较差，对天敌的种群数量和控害潜能也有影响。大面积推广应用转基因作物，为建立害虫生态控制和植物健康管理系统奠定了基础。从个体、种群、群落、系统等不同水平对转基因作物进行生态安全性评价，有助于提高转基因作物害虫的治理水平和制定农业持续发展的策略。