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雉科(Phasianidae)大都雌雄异色,雄性具有华丽的羽毛,雌性多具棕褐色隐蔽色。从形态来看,角雉、血雉和斑翅山鹑其尾较翅为短,尾羽的换序从中央到外侧,这些特征与鹑族(perdicini)各属相同被划为鹑族:勺鸡与原鸡,雌雄异色,被划为雉族(phasianini)。长期以来对它们的分类地位一直存在着争议。在此我们通过PCR扩增鸡形目黄腹角雉(Tragopan caboti)、环颈雉(Phasianuscolchicus)、原鸡(Gallus gallus)、鹌鹑(Coturnixcoturnix)、石鸡(Alectoris chukar)、斑翅山鹑(Perdixdauuricae)、绿孔雀(Pavo muticus)、勺鸡(Pucrasiamacrolopha)、红腹锦鸡(Chrysolophus pictus)、白腹锦鸡(Chrysolophus amherstiae)、白冠长尾雉(Syrmaticusreevesii)共10个属19个个体的线粒体DNA细胞色素b的部分基因,获取片段长度为828bp。由于一些种类的样本缺乏,还有一些种类不能用该引物扩增,因此从Genbank获取灰胸竹鸡(Bambusicolathoracica)、黑鹧鸪(Francolinus francolinus)、灰孔雀雉(Polyplectron bicalcaratum)、虹雉属(Lophophorus)、红胸角雉(Tragopan satyra)、灰腹角雉(Tragopan blythii)、红腹角雉(Tragopan temminckii)、马鸡属(Crossoptilon)、黑长尾雉(Syrmaticus Mikado)、黑颈长尾雉(Syrmaticus humiae)、白颈长尾雉(Syrmaticus ellioti)、鹇属(Lophura)、岩雷鸟(Lagopus mutus)、西方松鸡(Tetrao urogallus)、蓝镰翅鸡(Falcipennis canadensis)、血雉(Ithaginis cruentus)等雉科和松鸡科(Tetraonidae)的22种样本的相应序列,以角叫鸭(Anhima cornuta)和海龟(Kachuga dhongoka)为外群,对这20个属33种鸟类同源序列的比较分析,鸡形目20个属中,遗传距离雷鸟属与松鸡属之间最短为8.4％,锦鸡属与鹌鹑属之间最长为18.0％。角雉属与虹雉属最短为10.8％;血雉属与鹇属最短为13.3％;原鸡属、鹧鸪及竹鸡与勺鸡属最短,而与鹌鹑属最长;勺鸡属与虹雉属最短为10.6％;斑翅山鹑与马鸡属、虹雉属最短,与鹌鹑属最长为17.5％。
将雉科的15个属分为5个属及雉族和鹑族,遗传距离角雉属与雉类为13.5％,与鹑类为15.3％;血雉属与雉类为15.1％,与鹑类为16.O％;勺鸡属与雉类为12.3％,与鹑类为13.5％:原鸡与雉类为14.8％。与鹁类为13.6％:斑翅山鹑与雉类为14.8％,与鹑类为16.3％。分别用邻接法(Neighbor-joining method)和最小进化法(Minimumevolution method)对鸡形目(Galliforms)和雉科鸟类构建分子系统树,在鸡形目中,NJ树中血雉与松鸡科聚类,角雉支系与雉类被松鸡科隔开,而在ME树及雉科种类的系统树中,都是角雉与雉类相聚。雉类的长尾种类马鸡属、雉属、锦鸡属、长尾雉属、鹇属始终聚在一起,角雉属、虹雉属与斑翅山鹑形成一个支系,共同组成雉类。勺鸡为一个独立分支,松鸡科的松鸡属、雷鸟属与镰翅鸡属始终形成一个支系,竹鸡属、鹧鸪属与原鸡属始终形成一个支系,鹑类的石鸡属与鹌鹑属聚在一起,中间的孔雀雉属、孔雀属两支将竹鸡属所在支系与鹑类分开。其结果表明:血雉、角雉与斑翅山鹑应归于雉类,而勺鸡和原鸡分别为一独立分支。它们在系统树中分枝短,支持率低,说明在早期进化中可能发生过快速的适应辐射。根据化石资料、鸟类现在的分布以及分子钟推测:角雉可能于上新世起源于横断山脉的四川西南部或云南北部地区。随着气候的逐渐变冷,黄腹角雉向南迁移;由此分两支:一支往西,分布于喜马拉雅山脉地区,另一支黄腹角雉往南,分布于我国东南部。血雉结合亚种分化,可能起源于中新世横断山脉的四川西南部地区。温度的变化以及高山、峡谷形成的复杂生境,使其分化出的各个亚种分为两支:一支往西,分布于喜马拉雅山脉地区,另一支往北,分布于我国西北部,而四川亚种则生活在其发源地。勺鸡为独立进化的一个类群,大约在晚上新世起源于横断山脉的云南地区。随着气候的变冷,亚种的分化形成两支:耐寒的一支向西部及北部高海拔区迁移,喜温的一支向东部低海拔处迁移。原鸡划归雉类不妥,竹鸡、原鸡、鹧鸪可能为同一祖先起源于中新世南亚大陆。斑翅山鹑为雉类。根据化石和现在的分布斑翅山鹑和松鸡科可能都起源于中新世欧亚大陆北部,在系统发生树中,松鸡科与雉科的其它属形成一个平行支系,说明松鸡科还达不到"科"的级别。位于横断山脉的云南或四川地区可能为中国雉科鸟的起源中心。血雉、角雉、原鸡、斑翅山鹑和勺鸡等种类,出现分类地位的不确定性,说明雉和鹑可能不是单系群:也说明雉和鹑的分类只是形态特征上的意义,而不代表它们之间的系统发生关系。