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采用直接测序法，测定了中国沿海互花米草8个种群80个样本的叶绿体 trnT-trnF序列。结果显示：2个单碱基的插入/缺失将80个序列分为3种单倍型，3种单倍型在美国东海岸均有分布，且属于美国分布最广泛的C单倍型；中国种群的单倍型多样性Hd为0.379，远低于美国原产地；种群间基因分化系数Gst为0.103、地理单元件遗传分化系数GammaSt为0.165、遗传分化指数Fst为0.0916；AMOVA分析揭示种群间仅有9％的遗传差异。研究结果表明，中国互花米草种群受瓶颈效应影响明显，种群间遗传变异较低，种群内多样性相对较高。