利用系统进化树对H7N9大数据预测传播模型的评估

• 作 者: 杜鹏程[1]于伟文[1]闫鹏程[2]安云鹤[3]陈晨[1]
• 机 构: 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,传染病预防控制国家重点实验室,北京102206
• 出 处: 中国生物工程学会2014年学术年会暨全国生物技术大会
• 发表日期: 2014年期

　　流行病学研究表明H7N9禽流感病毒的传播和活禽贸易之间存在关联。应用大数据技术分析活禽交易的网络数据，可获得活禽贸易信息，进而进行疫情溯源并预测未来传播趋势。为对大数据预测得到的H7N9传播模型进行评价，从流感研究数据库中获取了截止至2013年分离得到的H7N9毒株的血凝素基因核酸序列，使用RAxML软件构建了系统进化树推断2013年上半年疫情中H7N9在各省及城市间的传播情况，并与大数据推断结果进行了对比分析。结果表明，系统进化树推断结果更为准确，但大数据分析能够提供更多地区的信息且具有更好的时效性，同时推断的传播模型准确度较高，在H7N9疫情的应对中具有较高的应用价值。