南黄海浒苔(Enteromorpha prolifera)四种基因序列的变异

• 作 者: 姚雪;张静;刘涛;
• 机 构: 中国海洋大学,青岛,266003
• 出 处: 庆祝中国藻类学会成立30周年暨第十五次学术讨论会
• 发表日期: 2009年期

本文对采集于2008-2009年间南黄海近海25个地理居群的浒苔(E. prolifera)的18S rRNA基因、rDNA ITS区, rbc L基因及coxl基因进行了PCR克隆及序列测定，分析了不同序列的变异范围；I朽区序列的种内遗传距离为0[％]-6.8[％]，rbc L基因的种内遗传距离为0[％]-3.2[％],18S rRNA基因的种内遗传距离为0[％]-1.0[％]，coxl基因的种内遗传距离为0[％]-44.6[％]。同时结合GenBank数据库中浒苔属其他物种、曲浒苔(E. flexuosa)、条浒苔(E.clathrata),缘管浒苔(E. linza)的相应序列分析了浒苔属不同物种三种序列的种间变异范围:ITS区序列的种间遗传距离为0.5[％]-57.8[％],rbc L基因的种间遗传距离为0.3[％]-4.4[％], 18S rRNA基因的种间遗传距离为0[％]-1.3[％]。尽管所测定的3种基因的序列遗传距离总体上小于已知属内物种，但仍显示出了较高的遗传变异，体现在采用Neighbor-Joining方法对各个基因片段构建聚类图中，只有根据ITS区构建的聚类图中浒苔属不同物种分别聚类到不同的进化枝上，而根据18S rRNA基因、rbc L基因聚类结果则不能明显体现出该属不同种之间的差异。本研究进一步分析了浒苔( E. prolifera)不同地理居群(包括美洲、亚洲、欧洲等地区的ITS区的变异范围，结果表明，太平洋美洲遗传距离最小，为0.6[％]，而中国南黄海25份样品与美国华盛顿布莱克利岛的遗传距离最大，为56.8[％]。在NJ聚类图中，美国华盛顿布莱克利岛与美国加利福利亚索尔顿湖，中国黄海，中国南黄海，苏格兰阿伯丁郡与北爱尔兰斯特朗福德湖分别聚类到四个进化枝上，显示出较明显的地域性差异。