【摘 要】
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目的：探讨广州地区婴幼儿感染的诺如病毒ORF2基因序列特性,分析诺如病毒广州株NVgz01基因型。方法：在成功克隆诺如病毒广州株NVgz01全长基因组并测序基础上,将诺如病毒广州
【机 构】
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广州市妇女儿童医疗中心病毒研究室,广州510120
【出 处】
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病毒感染与儿科消化系统疾病专题研讨会
论文部分内容阅读
目的：探讨广州地区婴幼儿感染的诺如病毒ORF2基因序列特性,分析诺如病毒广州株NVgz01基因型。方法：在成功克隆诺如病毒广州株NVgz01全长基因组并测序基础上,将诺如病毒广州株NVgz01的ORF2基因单独进行序列特性分析和基因型分析。结果及结论：ORF2编码主要结构蛋白衣壳蛋白(VP1),VP1蛋白有两个主要区域：P区(protruding)和S区(shell,)。将病毒株NVgz01的S区与诺瓦克病毒GⅡ组中的18个基因型(除GⅡ-11、15、16型外)的S区核苷酸序列进行同源性比较,显示NVgz01与GⅡ-4基因型的Grimsby、Farmington Hills等的S区核苷酸同源性为最高(92%-95%),而与其它基因型为67%-72%。对ORF2基因的P2区域进行氨基酸序列比对分析,发现P2区域上存在两个抗原表位和四个与HBGAs受体相结合位点。以NVgz01株与诺如病毒GⅡ-4基因型病毒株的P区域构建了GⅡ-4基因亚型系统发育树,显示NVgz01处于GⅡ-4e亚型组中。
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