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针对端对端网络时钟同步中的时钟漂移问题,首先提出了一种精确测量端对端时钟漂移的算法;接着分析了传统线性补偿方法,并提出了一种用最小二乘来求取补偿直线的算法;最后提出了动态非线性预估补偿方法及其实现算法,并通过实验证明这种方法与传统线性补偿方法相比能更好地补偿时钟漂移问题,从而说明该方法的优越性、有效性和可行性。