茶树中一个赤霉素受体基因(CsGID1a)的克隆及生物信息学分析

来源 :第七届海峡两岸茶业学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xinxinde1986
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  赤霉素受体作为首先与赤霉素结合的关键元件,在赤霉素信号转导中发挥重要作用.依据GenBank中已知的其他植物赤霉素受体基因(Gibberellin insensitive dwarf1),利用CODEHOP在线设计简并引物,采用RT-PCR和RACE技术在茶树中克隆到一赤霉素受体基因cDNA全长,命名为CsGID1a(登录号:JX235369).该基因全长1411bp,开放阅读框1023bp,编码341个氨基酸,预测其编码蛋白分子量为38.53KD,理论等电点为5.62.生物信息学分析显示CsGID1a具有激素敏感性脂肪酶(HSL)家族蛋白的功能域(HGG、GXSXG)和典型的三级空间结构.相似性比较及系统进化分析表明,CsGID1a氨基酸序列与其他物种的相似性均在60%以上,与葡萄的相似性最大达87%,与葡萄的关系也最近.
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