【摘 要】
：
在蛋白质工程(酶工程)研究中,预测定点突变酶的生物活性是一个重要的研究课题,对提高实验效率,降低实验成本有重要帮助。本文介绍我们新近发展的基于氨基酸理化性质的“物理-化学人工神经网络”(Phys-Chem ANN)及在酶工程中的应用。在生物信息学中广泛使用的“人工神经网络”(Artificial Neural Network：ANN)是以生物体的神经系统(或人的大脑)为模板建立起来的,缺乏物理和化
【机 构】
：
广西科学院,大理路98号,南宁,广西 530004 广西亚热带资源保护与利用重点实验室,广西大学,南宁,广西 530004
【出 处】
：
2008年全国酶制剂研究开发应用技术研讨会
论文部分内容阅读
在蛋白质工程(酶工程)研究中,预测定点突变酶的生物活性是一个重要的研究课题,对提高实验效率,降低实验成本有重要帮助。本文介绍我们新近发展的基于氨基酸理化性质的“物理-化学人工神经网络”(Phys-Chem ANN)及在酶工程中的应用。在生物信息学中广泛使用的“人工神经网络”(Artificial Neural Network：ANN)是以生物体的神经系统(或人的大脑)为模板建立起来的,缺乏物理和化学的理论基础,因而无法对其计算和预测结果给出有物理和化学意义的解释。理化人工神经网络(Phys—Chem ANN )是依据物理化学的基本原理,结合蛋白质的结构特征建立起来的。在理化人工神经网络中,隐蔽层不再是没有真实意义的虚拟的“神经元”,而是蛋白质的结构单元：氨基酸残基(和／或结构域)。理化人工神经网络共有三个层次,输入层是氨基酸的理化性质参数;隐蔽层是在生物活性中起重要作用的氨基酸位点,输出层是蛋白质完成的生物功能。这三个层次组成了一个有反馈功能和机器学习能力的网络。在三个层次间,依据物理化学的原理。建立了以氨基酸理化性质为参量的线性自由能公式,用以表达蛋白质的生物活性。在线性自由能公式中,理化人工神经网络的三个层次由两组系数相连接,一组是活性氨基酸的理化性质的权重因子,另一组是活性氨基酸位点的权重因子。我们发展了一种“迭代的双最小二乘”(IDLS)算法,在训练集里迭代地和交替地解两组系数,建立起预测模型。该模型可用于预测其它变异蛋白质的生物活性。与同类方法相比,理化人工神经网络法不仅有较强预测能力,还可以对预测结果给出有物理化学意义的解释。有助于提高酶工程实验的效率,减少盲目性。
其他文献
为克服聚合物驱油剂溶解困难,耐温、耐盐、耐剪切性能差等缺点,本文首先合成 了2-丙烯酰胺基八烷基磺酸(AMC8S)单体,并对其结构进行了红外光谱表征,然后以丙烯 酰胺(AM)、二甲基二烯丙基氯化铵(DMDAAC)和AMC8S为聚合单体,合成了含有疏水 碳链、磺酸基以及季铵盐等活性基团的速溶两性聚丙烯酰胺,分子量为400万,并对其结构及 溶解、耐温、耐盐以及耐剪切等溶液性能进行了详细的研究。
PVC-U管道因其众多的优点在输水领域得以广泛使用。在室外施工过程中，因环境、地形不断变化，需进行局部特殊处理，否则即使质量合格的管材也会出现各种事故。
饮水安全工程“十一五”期间约需要16亿米长的管道，生产输水管材的企业就需要提供大量合格管材，满足巨大的市场需求。新型PVC-M管道在安全性、便利性和经济性等方面具有很强的竞争优势，是饮水安全工程的一种理想选择。
钢丝网骨架聚乙烯复合管性能特点及在水平定向钻孔牵引敷设中的设计要点和注意事项。
本文从塑料截止阀对建筑给水管道系统所产生影响的角度，披露了塑料截止阀存在的问题。介绍了一种已投入市场的创新产品及其行业近况。
近几年新型塑料埋地排水管道推广应用异常迅猛、品种繁多、性能各异，给工程选用带来一定难度。本文试图从几类常用塑料埋地排水管道结构、工艺、性能和经济性等方面进行对比分析，为管道系统设计选材及施工提供一些依据。
钢带增强聚乙烯螺旋缠绕波纹管在国内外许多工程中得到了广泛的应用。天津市是我国的四大直辖市之一，国家将天津滨海新区的发展纳入国家发展战略，这为天津市的快速发展，为各行各业在天津市的发展提供了难得机遇和条件。本文的笔者对天津市市政管网概况进行了调查，对钢带增强聚乙烯螺旋波纹管的性能认真进行了分析，对国家及天津市推广、鼓励使用塑料管材的产业政策进行了研究，对使用钢带增强聚乙烯螺旋波纹管与混凝土管进行了经
本文对覆塑螺纹钢管的研发、生产工艺与设备、工程应用等情况作以技术性概要介绍，同时对执行的技术标准、工程规范加以说明，并提出成套设备制造预期。
本文阐述影响砌块热工性能的主要因素，利用二维模拟分析软件Ptemp，对影响砌块相关参数的因素作了定性的分析，然后对如何在有限的条件下，研制出节能效果更好的砌块以及空心砖作了总结并给出建议。