猪戊型肝炎病毒上海株全基因组序列分析

来源 :中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会成立大会暨第一次学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:YAOGUOCHUN
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目的:分析上海猪swChinash HEV与已知其它HEV基因型的差异和人源HEV的关系。 方法:设计22对PCR引物,分片段进行扩增,两末端采用快速扩增方法(RACE)扩增,扩增产物克隆到pMD18-T载体并测序,用DNASTAR软件与53株人源和猪源HEV的基因组进行同源性分析,用Clustalx和Mega3.0软件绘制基因进化树。 结果:swChinash全序列除去poly(A)尾,由7235个核苷酸组成,ORF1-3分别编码1707,660,122个氨基酸。全基因序列与Ⅳ型的核苷酸同源性为83.4%~84.7%,与其他三型为73.3%~76.3%,其中与中国人源长春株最高,为84.7%。 结论:基于ORF1~3和全长基因组的进化树,猪HEV上海株swChinash属于基因Ⅳ型,与其他Ⅳ型HEV亲缘关系较远,单独在一个进化分支上。
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目的:研制检测LM的胶体金试纸。方法:原核表达ActA蛋白并进行亲合层析纯化;检测表达蛋白ActA的免疫原性;以表达的蛋白为检测抗原研制LM单克隆抗体;利用所制备的单抗建立检测LM的胶体金试纸方法,并对试纸的特异性、敏感性及模拟样品进行试验。结果:在大肠杆菌中表达了ActA蛋白,纯化蛋白的纯度在90%以上;表达蛋白诱导了特异性的细胞免疫和体液免疫,具有良好的免疫原性;获得了4株抗ActA单抗;研制
WhoA基因编码光滑型布氏杆菌脂多糖(LPS)O-侧链合成必须的糖基转移酶,该基因的缺失或破坏会影响布氏扦菌光滑型表型的形成。本研究以猪源光滑型布氏杆菌S2株为研究对象,通过同源重组将氯霉素抗性基因(Omr)完全替代S2株的WhoA基因,获得重组粗糙型布氏杆菌rS2-WboA株。rS2-WboA株在适宜的培养基(TSA)上传50代后仍保持对氯霉素的抗性。用1×107 CFU rS2-WboA免疫B
为探讨猪链球菌2型(Streptococcus suis typc2,SS2)次黄嘌呤核苷酸脱氢酶(IMPDH)的生物学特性及其致病的相关性,选用自杀性质粒,通过同源重组成功构建具有氯霉素基因缺失株IMPDHm。PCR鉴定,IMPDH基因被cat基因表达盒所代替;Western blot鉴定,IMPDH单抗没有检测到相应的IMPDH蛋白。IMPDHm培养特性和致病性发生较明显的变化,其利用糖的能力
本研究采用PCR技术扩增了鹅和番鸭全长细小病毒基因;其中鹅和番鸭细小病毒非结构基因(NS)全长为1884bp,编码627个氨基酸;结构基因(VP)全长为2199bp,编码732个氨基酸;序列分析表明:鹅和番鸭细小病毒NS间的核苷酸和氨基酸同源性分别为80.9%~82.9%和89.5%~91.2%,而相应的鹅细小病毒间的同源性为93.7%~99.8%和96.8%~99.7%,番鸭细小病毒间的同源性为
利用MDBK细胞从临床表现典型口疮症状的病羊痂皮材料中分离获得1株病毒,通过形态学、理化学、PCR检测与动物回归试验等对该株病毒进行系统的分离鉴定后,证实该分离株为羊传染性脓疱病毒(Off virus,ORFV),命名为ORFV-sy。参照Genbank中羊传染性脓疱病毒的B2L、F1L基因的核苷酸序列,设计合成特异性引物,成功地对ORFV-sy株的B2L和F1L基因进行克隆、测序,并推导出其相应
根据B病毒E2490株(登录号AF533768)人工合成猴B病毒gB基因,通过XbaI和EcoRI特异性酶切,将其亚克隆于昆虫杆状病毒表达载体pFastBacHTA,经PCR、酶切及测序鉴定。表明构建了猴B病毒gB基因杆状病毒表达重组质粒pFastHTA-gB。在此基础上,重组质粒转化DH10Bac感受态细胞,经平板抗性筛选,PcR鉴定,表明获得了转座的杆粒,为下一步进行昆虫细胞的转染和以猴B病毒
通过应用酶联免疫吸附试验(Enzyme-Linked immunity assay,ELISA)方法。对青海农区猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproduction and respiratory syndrome,PRRS)进行血清流行病学调查。五年来(2003年-2007年)所采集猪血样9788份,用美国IDEXX公司的血清PRRSV抗体检测试剂盒检测,其血清抗体阳性率是10.6%。结
猪圆环病毒2型(PCV2)是引起断奶仔猪多系统衰竭综合症(PMWS)的重要病原,给养猪业带来巨大的经济损失。本研究以PCV2 GZ株为研究对象,经生物信息学软件分析其ORF2抗原性的分布特点,参照资料报道,选定ORF2基因的主要抗原位点分布区域(tORF2),PCR扩增后亚克隆至表达载体pET32a,构建重组表达质粒pET-tORF2并转化大肠杆菌RosettaⅡ(DE3)。经IPTG诱导后进行聚
利用λ噬菌体的Red重组系统,将氯霉素抗性基因(cat)插入到大肠杆菌0157:H7 Min27株的stx2基因中,获得O157:H7 Min27的突变菌株Min27(△six::cat)。用丝裂霉素对该突变菌株进行诱导,结合抗性标记和PCR方法筛选出一株突变的Stx2噬菌体,命名为φMin27(△stx::cat)。将φMin27(△stx::cat)感染21株不同血清型的大肠杆菌,采用双层琼脂
采用PCR方法对62株大肠杆菌菌株进行stx基因检测,将筛选到含有stx基因的菌株进行噬菌体诱导、分离、纯化和鉴定,并对编码Stx2的噬菌体(Stx2噬菌体)相关基因进行序列测定。将分离的Stx2噬菌体溶源大肠杆菌MC1061实验菌株,获得的Stx2噬菌体溶源菌作为指示菌筛选诱导细菌滤液中的Stx2噬菌体以外的噬菌体。实验中筛选到8株大肠杆菌O157菌株经丝裂霉素c诱导后均优先释放Stx2噬菌体,