不同禽源副粘病毒分离株HN基因的克隆与序列分析

来源 :中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会第二次学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yu0426
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分别对源于安徽某地同期分离鉴定的鸡源、鸭源、鹅源NDV致病株(WF00C、WF00D、WF00G)的HN基因进行RT-PCR扩增、克隆和序列测定,并对其核苷酸和推导氨基酸序列进行分析。结果显示,各分离株HN基因均含1个完整的开放阅读框(ORE),全长为1716bp,编码571个氨基酸,有5个潜在的糖基化位点,13个半胱氨酸(Cys)残基。WF00D株与WF00C株、WF00G株以及Genebank下载的16株各基因型代表株的HN基因编码区的同源性进行比较,其核苷酸序列同源率为82.1~99.6[%],推导的氨基酸序列同源率为88.1~99.3[%];三个不同禽源分离株间的同源性较高,其中鸭源、鹅源同源性最高,并与ZJ1、SF02和NA_1等鹅源毒株和鸭源毒株FP1/02之间差异较小。HN基因系统发育进化树分析显示,该三个不同禽源NDV致病性分离株均归为基因Ⅶ型。
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