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本文结合肉苁蓉野生资源与生态环境的现状调查以及多年来的种植繁育研究，采用形态描述和分子标记分析相结合的方法，通过对肉苁蓉生长发育过程中的生理和生殖等生物学特性研究、生物学性状多样性分析及其DNA分子遗传多样性的AFLP分析，对肉苁蓉濒危机制进行更全面研究和探讨。结果表明：肉苁蓉种内DNA分子遗传多样性较丰富，并在形态特征、产量及品质性状等方面多样性显著，说明现阶段该物种的种内丰度较高，其濒危原因不在于此;而肉苁蓉的专性寄生、生长缓慢、自交不亲和、种子休眠等脆弱的生物学特性使其在受到长期的人为干扰时自我更新困难，导致濒危。因此，建立管理规范的自然保护区，并配合野生抚育，同时大力发展人工种植，是提高其蕴藏量并实现资源可持续利用的根本方向。