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为了解我国H9N2亚型禽流感病毒(AIV)在养殖鸡群中的流行变异规律，本研究从2010年2月至2011年2月在我国9个省区发病鸡群中分离到20株H9N2亚型AIV，并对所有分离株进行了血凝素(HA)基因克隆与测序。序列分析结果表明，分离毒株HA基因开放阅读框(ORF)长度均为1683bp，编码560个氨基酸。分离株之间HA基因核苷酸序列同源性在89.0％～100％之间，其推导的氨基酸序列同源性在92.0％～100％之间；与3株国内疫苗毒株(SS94、SD696、F98)HA基因核苷酸同源性在90.4％～92.7％之间，氨基酸序列同源性在92.0％～95.0％之间。分离株HA蛋白裂解位点附近序列共存在3种形式：PSRSSR↓GLF、PARSSR↓GLF和PSKSSR↓GLF，均无连续碱性氨基酸的插入，符合低致病性禽流感的特征。遗传进化分析表明，分离株和疫苗株均属于欧亚种系类Y280亚分支，但在亚分支内部分离株和疫苗株亲缘关系较远，一定程度上反映了当前我国H9N2亚型流行毒株与主要疫苗毒株之间的进化距离，为疫苗株的更新筛选奠定了理论指导基础。