【摘 要】
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选用100只20周龄的健康状况良好,体重相近的白来航鸡为试验材料,随机分成2组,60只接种肠炎沙门菌,作为试验组,另外40只接种等剂量的PBS,作为对照组。两组鸡分开饲养,饲养条件相同。
【机 构】
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山东农业大学动物科技学院,山东泰安271018
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选用100只20周龄的健康状况良好,体重相近的白来航鸡为试验材料,随机分成2组,60只接种肠炎沙门菌,作为试验组,另外40只接种等剂量的PBS,作为对照组。两组鸡分开饲养,饲养条件相同。分别在接种后8天和16天随机选择对照组11只,试验组29只采集脾脏组织样品,保存于RNA保存液中,于一20℃保存用于RNA的提取。采用Trizol法抽提RNA并纯化,每个时间点每组内随机选取8个样品,组内两两混合,形成16个RNA混池,用安捷伦4x 44K鸡全基因组表达芯片进行杂交。采用SAS软件进行数据处理与分析,并用DAVID在线分析工具对差异基因进行GO注释分析。接种后8天的实验组和对照组进行比较,沙门氏感染后共有1371个基因的表达差异显著,其中包括689个下调基因和682个上调基因,在下调基因中差异倍数最大的基因为LOC416235(5.453),在上调基因中,差异倍数最大的基因为LOC417973(7.047);接种后16天的实验组和对照组进行比较,沙门氏感染后共有692个基因的表达差异显著,其中包括319个下调基因和373个上调基因,在下调基因中差异倍数最大的基因为HBE1(4.132),在上调基因中差异倍数最大的基因为INPPSF(5.237)。分别对上调和下调差异基因进行GO分析,差异基因分布在多个不同的生物学过程,同时相同的基因有可能出现在不同的生物学过程中。沙门菌感染致使某些和免疫相关的基因差异表达。
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