小RNA测序结合RT-PCR鉴定一种侵染梨的负义单链RNA病毒

来源 :中国植物病理学会2016年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wujunming123123

【摘要】

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RNA沉默是植物抗病毒机制之一,小RNA (sRNA)测序及现代生物信息学技术的发展为病毒鉴定提供了一种新手段。本研究采用sRNA测序技术对一株表现疑似病毒病的梨树叶片进行分析,采用Velvet软件对sRNA进行拼接,然后对获得的contigs在NCBI数据库进行BLASTn和BLASTX搜索,鉴定出5个contigs与欧洲山梣环斑病毒属(Emaravirus)的部分病毒的RNA1,RNA3和RN

【作者】

：

刘华珍王国平洪霓

【机构】

：

华中农业大学植物科学技术学院,农业微生物学国家重点实验室,武汉430070

【出处】

：

中国植物病理学会2016年学术年会

【发表日期】

：

2016年8期

【关键词】

：

RNA测序 RT-PCR 负义单链RNA病毒

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