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本文构建了南海海洋沉积物宏基因组的fosmid文库，重组克隆子数量近4万个，平均含外源片段长度为33kb,最长片段达65kb，容纳300多个细菌的基因组。通过功能筛选以及表型差异筛选，找到了新的海洋淀粉酶、蛋白酶基因，以及发现了合成靛玉红、靛蓝和黑色素的相关基因簇，通过亚克隆及表达研究鉴定了这些有关基因。