【摘 要】
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合适的内参基因是准确归一化荧光定量数据的前提条件.然后,在已发表的研究中,内参基因筛选结果却各不相同.目的:本研究通过收集基因的geNorm 排名,数据转换和统计分析,系统评植物在干旱和盐胁迫下各个内参基因.结果:尽管没有一种基因在盐和干旱胁迫下保证表达普遍稳定,但是我们发现18S 基因是普遍不稳定的基因.18S 不应该做为荧光定量的内参基因.相反,用EF1 作盐胁迫下内参基因和用TIP41 做干
【机 构】
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中国科学院新疆生态与地理研究所干旱区生物地理与生物资源重点实验室,新疆乌鲁木齐;中国科学院大学,北京
【出 处】
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2015年中国地理学会西北地区学术年会
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合适的内参基因是准确归一化荧光定量数据的前提条件.然后,在已发表的研究中,内参基因筛选结果却各不相同.目的:本研究通过收集基因的geNorm 排名,数据转换和统计分析,系统评植物在干旱和盐胁迫下各个内参基因.结果:尽管没有一种基因在盐和干旱胁迫下保证表达普遍稳定,但是我们发现18S 基因是普遍不稳定的基因.18S 不应该做为荧光定量的内参基因.相反,用EF1 作盐胁迫下内参基因和用TIP41 做干旱胁迫下内参基因风险要小的多.我们通过T 检验比较了7 种常用内参基因在盐和干旱胁迫下的稳定性,UBQ在干旱胁迫下显得更加不稳定.内参基因的稳定性在不同的研究中表现不同,可能是这些基因属于多基因家族的原因,这个推论得到盐角草转录组表达谱分析的支持.这项工作量化分析了各个植物内参基因在盐和干旱胁迫下的稳定性,这将促进将来内参基因的筛选工作.
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