【摘 要】
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目的:对鼠诺如病毒分离株BJ10-2062进行全基因组序列测定,并对测序结果进行亲缘关系等分析.方法:参照NCBI发表的MNV1(AY228235)全基因组序列设计引物,根据测定的结果设计下一
【机 构】
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中国食品药品检定研究院-实验动物资源研究所北京100050
【出 处】
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2013‘第十一届中国北方实验动物科技年会
论文部分内容阅读
目的:对鼠诺如病毒分离株BJ10-2062进行全基因组序列测定,并对测序结果进行亲缘关系等分析.方法:参照NCBI发表的MNV1(AY228235)全基因组序列设计引物,根据测定的结果设计下一步引物,分段扩增测序,最后将所测各段拼接;对分离株的全基因组序列进行分析,与人源、牛源和其他鼠诺如病毒的代表株分别进行核苷酸和氨基酸序列的比较并进行亲缘关系分析.结果:鼠诺如病毒分离株BJ10-2062基因组全长7381bp,G+C含量56.63%,A+U含量43.33%,含3个开放读码框.基于全基因组核酸序列构建的亲缘关系树表明,BJ10-2062与其他鼠诺如病毒分离株均属于genogroup V,与美国的CR4和NIH-A114株亲缘关系最近,并与美国的其他NIH系列毒株一起形成一个独立的分支.结论:对鼠诺如病毒BJ10-2062分离株全基因组的测序分析,为进一步研究鼠诺如病毒特性的分子生物学机制打下了基础.
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