【摘 要】
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目的:对糖苷水解酶第78家族(glucoside hydrolase family 78,GH78)真菌α-L-鼠李糖苷酶保守区及进化关系分析.方法:应用CluaalW2软件对87条GH78家族真菌α-L-鼠李糖苷酶进
【机 构】
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集美大学食品与生物工程学院 福建厦门361021
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目的:对糖苷水解酶第78家族(glucoside hydrolase family 78,GH78)真菌α-L-鼠李糖苷酶保守区及进化关系分析.方法:应用CluaalW2软件对87条GH78家族真菌α-L-鼠李糖苷酶进行多重序列比对,利用Block Maker进一步分析,得到了该家族真菌共有完全氨基酸保守位点及保守区;利用SignalP 4.1 Server对序列进行信号肽预测;应用MEGA 6.0软件对ClustalW2结果进行遗传距离分析并构建分子系统进化树.结果:GH78家族真菌87条序列虽然长度不等,但均包含AHGWSTGPTY、VTLDTGQNVAG、NELSIPTDGAKRD 3个保守区及多个完全保守氨基酸位点;87条序列中29条含有信号肽;属间遗传距离为0.7 ~48.5,种间遗传距离为0.4 ~48.5;分子系统进化树并不是依靠菌株来源进行聚类,而是依据是否为胞外酶进行聚类.讨论:该研究分析了GH78家族真菌α-L鼠李糖苷酶的保守区及进化关系,为α-L-鼠李糖苷酶的工程改造奠定了基础.
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