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为建立甘蔗品种抗感黑穗病性分子检测技术，采用集群分离分析法与RAPD相结合，对杂交亲本ROC20、桂11和部分杂交后代以及标准对照种进行PCR扩增，筛选到一条可区分甘蔗品种抗感黑穗病性的多态性片段。采用pMD18-T克隆载体，对该片段进行克隆和测序。根据测序结果，设计一对长度分别为23bp和21bp的上、下游引物。对上述材料进行SCAR标记验证，结果显示，扩增结果和RAPD标记结果一致，RAPD标记已经被成功地转化为SCAR标记。该SCAR标记有望用于甘蔗抗、感黑穗病基因型的鉴定。