【摘 要】
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脑心肌炎病毒(Encphalomyocarditis virus，EMCV)可引起的猪、某些哺乳动物乃至灵长类动物以脑炎、心肌炎或心肌周围炎。本研究以脑心肌炎病毒(Encphalomyocarditis virus,EMCV
【机 构】
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中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京,100193
【出 处】
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中国畜牧兽医学会信息技术分会第十届学术研讨会
论文部分内容阅读
脑心肌炎病毒(Encphalomyocarditis virus，EMCV)可引起的猪、某些哺乳动物乃至灵长类动物以脑炎、心肌炎或心肌周围炎。本研究以脑心肌炎病毒(Encphalomyocarditis virus,EMCV) HB10株VP2基因为目的基因,建立EMCV快速诊断方法;并对VP2基因进行克隆、测序并用生物信息学技术分析EMCV-HB10-VP2蛋白的糖基化位点、磷酸化位点、信号肽、B细胞抗原表位及其二、三级结构.结果表明,成功克隆了EMCV-HB10-VP2基因;构建重组质粒pEGFP-HB10-VP2,并以此质粒作为阳性模板建立了特异性好、灵敏性高的EMCV快速诊断方法;生物信息学分析表明,EMCV-HB10-VP2蛋白可能存在4个糖基化位点;对磷酸化位点预测:丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸分别有:6个、7个、3个位点可能存在磷酸化;可能存在6个B细胞抗原表位;对EMCV-HB10-VP2蛋白二级结构进行预测,α-螺旋占12.50％,β-折叠区域占27.34％,无规则卷曲占60.16％;三级结构存在多个螺旋和折叠区域,主要以无规则卷曲为主.本研究结果为EMCV临床样本的快速筛检提供技术支持,同时EMCV-HB10-VP2蛋白的生物信息学分析为EMCV分子诊断试剂及基因工程疫苗研究等提供参考.
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