比较基因组学鉴定猪链球菌新型多重耐药基因嵌合元件

来源 :中国畜牧兽医学会兽医药理毒理学分会第十一届会员代表大会暨第十三次学术讨论会与中国毒理学会兽医毒理专业委员会第五次学术研讨 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tienan
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  (目的)本研究旨在分析猪链球菌的基本遗传特征,鉴定介导多重耐药猪链球菌的可转移遗传元件,为研究其水平转移规律和进化路径提供参考.(方法)通过对临床分离的猪链球菌进行全基因组测序,采用比较基因组学方法,分析其基因组成,鉴定基因组上的可转移遗传元件,分析其与耐药基因水平传播的关系.(结果)猪链球菌临床败血症病猪分离株YY060816基因组草图由73个contig组成,大小为2,088,157 bp,GC含量为41.1%.在2,097个预测的基因中,2,055个预测编码蛋白;其中1,500个(71.53%)可进行COG功能分类;在356个(17%)移动基因中,绝大部分来源于质粒(69.7%)和原噬菌体(27.5%),基因组含有一个由tet(O)-carrying ICESsu05ZYH33(89K)-like ICE和mef(A)-carrying Φm46.1-like prophage组成的嵌合基因组岛,该基因组岛整合入rum的3'端特异性整合位点CAC(A)T(A)GA(A)(G)(T)TGT;比较菌株SC070731和YY060816的127K表明,该基因组岛可能是由89K-like ICEs部分整合入原噬菌体部分的左侧或右侧的att位点嵌合合成,并可能保持其环化和切除能力;MIC结果显示127K基因组岛介导了包括四环素类和大环内酯类在内的多重耐药.(结论)猪链球菌YY060816基因组中17%的基因为移动基因,提示基因的转移在该类细菌中极为常见;127K是由tet(O)-carrying ICESsu05ZYH33(89K)-like ICE和mef(A)-carrying Φm46.1-1ike prophage嵌合而成的新型多药耐药嵌合元件,介导了猪链球菌对包括四环素类和大环内酯类在内的药物的多重耐药性.
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