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以陆地棉SG747与海岛棉Giza75为杂交亲本,并以陆地棉SG747为轮回亲本,构建BC2F4∶7回交近交系(backcross inbred lines,BIL)群体,选用2041对SSR引物进行亲本间多态性的检测,共筛选出在双亲间表现多态性的SSR引物431对(占21.17%),用于进行BC2F4∶6群体扩增,并产生了476个多态性位点。根据前人研究。定位到各染色体上有397个位点,图谱总长3677.1 cM,标记间的平均距离为9.21 cM。利用BC2F4∶6和BC2F4∶7家系4个环境下的产量性状数据,共定位到49个QTL位点,有44个的增益基因来自陆地棉。2个环境以上且效应方向一致的QTL3个,其中,铃重的1个,子棉产量1个,皮棉产量1个。可以进一步用于分子标记辅助选择。