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目的;观察感染EV71、CoxA16的手足口病患儿肠道排毒持续时间;探讨手足口病患儿肠道排毒时间与病情严重程度的关系.方法:对113例实验室确诊EV71、CoxA16感染的手足口病患儿进行追踪和随访,每间隔4-7天收集1次患儿的大便标本,用荧光PCR法进行病毒核酸检测,直至患儿大便病毒转阴为止.并用Kaplan-Meier生存分析法分析随访期内病毒核酸阳性率及不同组别间的分布差异.结果:113例患儿根据大便病毒检测结果进行分组:EV71阳性者65例,CoxA16阳性者44例,EV71、CoxA1混合感染者4例.EV71组、CoxA16组手足口病患儿的大便病毒核酸阳性率随时间的延长均呈下降趋势.大约75％的EV71组、CoxA16组手足口病患儿的大便病毒在第5周转阴.EV71病毒在手足口病患儿大便中持续最长时间为10周;CoxA16病毒在手足口病患儿大便中持续最长时间为6周.EV71组与CoxA16组患儿的大便病毒核酸阳性率的分布差异无统计学意义(χ2=0.18,P＞0.05).手足口病患儿根据病情轻重不同进行临床分类:普通型、重症.EV71普通型组和EV71重症组患儿的大便病毒核酸阳性率的分布差异有统计学意义(χ2=5.689,P＜0.05),EV71重症组患儿的肠道排毒时间长于EV71普通型组患儿.CoxA16普通型组和CoxA16重症组患儿的大便病毒核酸阳性率的分布差异无统计学意义(χ2=1.781,P＞0.05).结论：1.约75％感染EV71与感染CoxA16的手足口病患儿大便中的病毒在第5周转阴。2.EV71病毒在手足口病患儿大便中持续最长时间为10周;CoxA16病毒在手足口病患儿大便中持续最长时间为6周。3.感染EV71的手足口病患儿与感染CoxA16的手足口病患儿肠道排毒时间无明显差异。4.感染EV71的手足口病患儿的肠道排毒持续时间与病情轻重相关。