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菊粉是一种自然界广泛存在的糖类，近年来被广泛运用于食品添加剂、工业制乙醇等。通过研究内切菊粉酶对菊粉的水解过程，可以有效得到菊粉水解过程的关键氨基酸，对于提高工业产量十分有益。本文结合菊粉多聚合度的性质，建立两组菊粉分子(有葡萄糖，无葡萄糖)共13个配体分子与菊粉酶进行分子对接，运用Amber 14软件在AMBER力场下进行100ns分子动力学模拟，通过计算菊粉酶与不同菊粉分子的残基作用，可以分析菊粉在不同水解度下与菊粉酶的相互作用情况，得到菊粉酶水解过程的作用机理。