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分布式卫星作为航天器系统的前沿技术，已经成为当前的研究热点。本文针对分布式卫星的运行的空间恶劣环境和任务特点，研究分布式卫星嵌入式计算机系统的可靠性、安全性和实时性问题解决方案。在综合考虑分布式卫星嵌入式计算机系统设计要求的基础上，提出了分布、实时、容错、安全的一体化设计方法，提出了一种基于三级容错的主辅式双系统体系结构设计方案。对三级容错设计、基于可信平台模块(TPM)的主辅式双系统安全设计进行了详细的阐述。