甘蓝型油菜中水孔蛋白BnPIP3-like序列和结构初步研究

来源 :中国作物学会油料作物专业委员会第七次会员代表大会暨学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:awaydedao132
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  水孔蛋白(aquaporin,AQP)是指细胞膜上能选择性地高效转运水分子的膜内在蛋白.迄今研究者已在多种植物体内发现AQP.但是对于我国最重要的一种油料作物甘蓝型油菜AQP的研究却很少.本研究利用拟南芥质膜定位水孔蛋白PIP3(GenBank:NP_195236.1)的mRNA序列设计引物,通过RT-PCR扩增,得到了甘蓝型油菜的846bp的基因片段,命名为BnPIP3-like.经序列分析和比对发现,BnPIP3-like基因与拟南芥PIP3的核酸序列相似性为91.7%;BnPIP3-like编码一个长度为281氨基酸的假定蛋白,与拟南芥PIP3蛋白的相似性为95.3%.与NCBI已公布的甘蓝型油菜AQP(GenBank: EU487188.1、EU487187.1、AF118381.1和AF118383.1)比对发现BnPIP3-like与其相似性分别为64.97%、65.31%、31.93%和74.56%,所以BnPIP3-like是一个崭新基因编码的蛋白.在线的蛋白质跨膜结构分析表明,BnPIP3-like 蛋白共有5个短环,6个跨膜α螺旋,6个螺旋共包含约131个氨基酸.其N端和C端都在胞质内,B环、D环位于细胞内,A环、C环及E环在细胞外,并且在B环和E环内部均发现了Asn-Pro-Ala高保守序列.进一步分析发现EU487188.1、EU487187.1和AF118383.1具有与BnPIP3-like高度类似的结构,而AF118381.1具有7个跨膜结构且C端在膜外.这可能与它们属不同亚类有关,AF118381.1属于γ-TIP(定位于液泡膜).这些分析不仅表明BnPIP3-like具有AQP的典型结构,是AQP家族中的一个新成员,而且为以后的功能验证等后续工作奠定了理论基础.
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