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中光層珊瑚生態系是指水深介於30 至150 公尺的珊瑚群聚。目前已有研究指出中光層珊瑚生態系可能是透光層珊瑚面對極端氣候事件或其他人為干擾的「避難所」。在台灣造礁珊瑚的研究主要集中於水深30 米以淺的透光層，而位於此深度以下的海域，其珊瑚多樣性以及這些礁區所扮演的角色仍有待發掘。因此，我們從2014年開始，在台灣東南海域之綠島進行中光層珊瑚生態系的研究，包括調查造礁珊瑚多樣性、珊瑚群聚組成、以及測量環境參數，並在此海域以附苗板進行珊瑚入添量的評估，以期能闡明台灣中光層珊瑚多樣性與群聚之組成。