【摘 要】
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随着新一代测序技术的发展,根据已有的EST和转录组序列开发genic-SNP标记已得到重视,也因其具有较高突变率和稳定性广泛应用于植物遗传研究中.在本研究中,以26个枇杷品种与资源为材料,利用9对引物扩增获得了总长度为4,183bp的基因组序列,获得多态性SNP位点103个,分布密度为1SNP/41bp,包括:55个转换,37个颠换,8个缺失或插入,3个其它类型.在这些转换和颠换的SNPs中,以A
【机 构】
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浙江省农业科学院园艺研究所 浙江杭州310021 宁海县林业特种技术推广总站 浙江宁海315600
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随着新一代测序技术的发展,根据已有的EST和转录组序列开发genic-SNP标记已得到重视,也因其具有较高突变率和稳定性广泛应用于植物遗传研究中.在本研究中,以26个枇杷品种与资源为材料,利用9对引物扩增获得了总长度为4,183bp的基因组序列,获得多态性SNP位点103个,分布密度为1SNP/41bp,包括:55个转换,37个颠换,8个缺失或插入,3个其它类型.在这些转换和颠换的SNPs中,以A/G,C/T,G/T,A/T G/C和A/C为主,数量和比例依次为31.1％(32),22.3％(23),13.6％(14),11.7％(12),6.8％(7),3.9％(4).另外,SNP状态有84个纯合位点,8个杂合位点.根据103个genic-SNPs位点多态性资料,应用MEGA程序构建了白沙和红沙枇杷种质的系统进化树.结果表明:所有枇杷品种均被区分鉴定开,而且没有形成白沙和红沙形式的两大组群,说明白沙与红沙枇杷在遗传上具有很高的相似性,是同一树种中某些性状(主要是果实)存在一定差异的不同品种类型.本研究所鉴定的新的genic-SNPs将为枇杷遗传多样性分析、分子标记辅助育种等研究提供可靠的数据信息.
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