论文部分内容阅读
目的：查明引起2004年宁波局部地区黄疸性肝炎疫情的病原，并分析其基因特征。 方法：用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血清中的甲型肝炎病毒IgM抗体(HAV IgM)和戊型肝炎病毒IgM抗体(HEV IgM)，利用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测粪便样品中的HAV核酸(RNA)并扩增VP1基因，测序结果利用DNAstar软件进行比对分析。 结果：172份血清样品中HAV IgM均为阳性，HEV IgM均为阴性。172份粪便样品中共检测到HAV RNA阳性样品74份，占43.02％。选择5份样品进行HAV VP1基因扩增并测序，测序结果经过比对后发现4株宁波株(NB2004-10、NB2004-11、NB2004-51和NB2004-71)的VP1基因是完全一致的；NB2004-75与以上4株的核苷酸的同源性为99.9％，氨基酸的同源性为99.7％；宁波株与HAV各基因型标准株比较，与IA亚型毒株AH2的核苷酸和氨基酸的同源性最高，分别为98.9％和99.7％～100％；与中国其他地区流行株比较，核苷酸和氨基酸的同源性波动于89.4％～96.7％和97％～100％。 结论：引起这次黄疸性肝炎疫情的病原是甲型肝炎病毒，其基因型为IA亚型，与日本株AH2、AH3亲缘关系最近，与中国其他地区流行株处于不同的进化簇上。