驴生长激素基因序列初步分析

来源 :2015中国驴业发展大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:daviid
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为进一步对GH基因的表达调控、基因多态性研究及其与生长速度、生产性能相关性及分子进化等方面研究提供必要的基础,以期为合理利用家驴的遗传资源,为培育优质、高效的肉用驴品种提供理论依据,本研究通过对驴的GH基因序列进行生物信息学方面的分析发现,驴GH基因共包含五个外显子和四个内含子.五个外显子连接在一起形成651nt的CDS区序列.整个CDS区翻译出216个氨基酸构成的多肽.驴GH基因编码的216个氨基酸中,大多数氨基酸为亲水性氨基酸.原始肽链的前20多个氨基酸序列出现一典型的疏水峰,经分析认为是该原始肽链的信号肽片段.驴的GH中的氨基酸以亮氨酸所占的比例最高(13.89%,共出现30次),其次为丙氨酸(10.19%,共出现22次),最低的为色氨酸(0.93%,共出现2次).驴生长激素的编码存在明显的密码子使用偏好.
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