【摘 要】
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[目的]近年来,转录组学分析技术的迅速发展,为从更加全面的角度理解化合物的生物效应提供了有益的帮助.本研究旨在应用RNA microarray技术结合高通量数据分析,对细颗粒物(PM2.5)引起的肺泡上皮细胞模型(A549)转录组改变及其生物效应进行研究.[材料和方法]100 μ g/mL PM2.5处理A549细胞24h,采用mRNAmicroarray技术分析转录组差异性表达；GO分类发现差异
【机 构】
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江苏省疾病预防控制中心毒理与功能评价所,南京210009
【出 处】
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中国毒理学会第七次全国毒理学大会暨第八届湖北科技论坛
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[目的]近年来,转录组学分析技术的迅速发展,为从更加全面的角度理解化合物的生物效应提供了有益的帮助.本研究旨在应用RNA microarray技术结合高通量数据分析,对细颗粒物(PM2.5)引起的肺泡上皮细胞模型(A549)转录组改变及其生物效应进行研究.[材料和方法]100 μ g/mL PM2.5处理A549细胞24h,采用mRNAmicroarray技术分析转录组差异性表达；GO分类发现差异表达基因的功能性富集.随后通过qRT-PCR技术对差异表达基因进行细胞学验证,并对经过细胞实验验证的差异表达基因进行基因-转录因子调控网络分析.A549细胞分别暴露于100和500 μ g/mL PM2.5 24h,测定其细胞周期和细胞凋亡水平.[结果]PM2.5处理A549细胞,引起464个基因表达上调及107个基因表达下调.GO分析发现其中30个差异表达基因参与细胞周期调控,30个差异表达基因参与细胞死亡过程调控,是最为显著的GO富集分类.PTPN6在该调控网络中发挥重要调控作用,其表达水平显著下调.A549细胞暴露于100和500 μ g/mL PM2.5 24h,引起A549细胞周期G2期阻滞；且死亡细胞比例分别为22.69±0.39％和70.31±0.57％,较对照组显著升高,表现出很强的细胞毒性作用.采用脂质体转染PTPN6质粒,使其在A549细胞内的表达恢复至对照水平,再经PM2.5处理,可显著降低细胞周期的阻滞以及死亡细胞的比例.[结论]通过以上研究发现,高通量技术不同于传统的毒理学分析方法,能够全面地揭示外源化合物的细胞生物学效应,促进发现新的关键分子通路.PTPN6在PM2.5产生的肺上皮细胞毒性作用中,可能发挥重要的保护性作用.
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